Le canal de Navigation passe à travers le quartier le plus pittoresque de Strasbourg, la Petite France, ainsi nommé à cause de l'hôpital qui s'y trouvait au XVIe siècle qui accueillait les malades atteints du "mal français", la syphilis. Ce quartier au Sud de la ville symbolise le vieux Strasbourg où le long des canaux se trouvaient des moulins, c'était le quartier des tanneurs. Le canal de Navigation relie la rue de la Bruche aux pieds des Ponts Couverts au pont Saint-Martin où il rejoint l'Ill. Sur son parcours se trouve une partie des plus belles maisons alsaciennes à colombages des XVIe et XVIIe siècles de Strasbourg.